تعتمد الخطة الدراسية في قسم الدراسات الإسلامية على منهج أكاديمي متكامل يجمع بين دراسة العلوم الشرعية الأساسية والفكر الإسلامي المعاصر، في توازنٍ بين الأصالة والتجديد.
يُدرس الطالب خلال أربع سنوات مقرراتٍ متنوعة تشمل علوم العقيدة، والفقه وأصوله، والتفسير والحديث، والسيرة النبوية، ومقاصد الشريعة، إضافةً إلى مواد تربوية وثقافية تنمي شخصيته الفكرية والدعوية.
وتهدف الخطة إلى إعداد طالب علمٍ راسخٍ في معارفه، واعٍ بقضايا أمته، قادرٍ على توظيف علوم الشريعة في خدمة المجتمع، وممارسة الدعوة والتعليم والبحث العلمي بروحٍ وسطيةٍ راشدة.